El Doctorado en Ciencias Odontológicas contempla 2 líneas de investigación, que son:
1).- Investigación Clínica y Epidemiológica.- Representa trabajos de investigación en la clínica en el área de odontología. Todos los temas relacionados con la clínica o que el modelo experimental son los sujetos se incluye en la presente LGAC.
2).- Investigación Básica y Nanobiomateriales Dentales. Son trabajos de investigación que implican las ciencias básicas, estudios in vitro y evaluación de nanobiomateriales dentales.
| Lineas de Generación y Aplicación del Conocimiento | Núcleo Académico Básico |
| Investigación Clínica y Epidemiológica | -Nuria Patiño Marín |
| -Gabriel Alejandro Martínez Castañón | |
| -María Guadalupe Martel Gallegos | |
| -Yolanda Terán Figueroa | |
| -Celia Aradillas García | |
| -Jesús Ramón Castillo Hernández | |
| -Yesica Yolanda Rangel Flores | |
-Sergio Zarazúa Guzmán | |
| Investigación Básica y Nanobiomateriales Dentales | -Nuria Patiño Marín |
| -Gabriel Alejandro Martínez Castañón | |
| -Facundo Ruiz | |
| -María Guadalupe Martel Gallegos | |
| -Nereyda Niño Martínez |
El 100% del los profesores del núcleo académico producen en el área de odontología en cualquiera de las 2 líneas de investigación generadas en el programa del Doctorado.
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